Pieniny leżą nad warstwą pyłowej atmosfery i są oddalone od ośrodków przemysłowych. W pobliżu Pienin nie występują wyraźniejsze przemysłowe źródła zanieczyszczenia powietrza. Obszar jest pomijalnie obciążony emisjami, dzięki odpowiedniemu położeniu i charakterowi bariery pochłaniającej spad opadu emisji przenoszonych z zachodu, oraz północno-zachodnich prądów powietrza. Ponadto czystość powietrza zapewnia również odmienna roślinność oraz zimą ciągła pokrywa śnieżna.
Dzięki swojemu położeniu o poziomie stymulacji 1, uzdrowiska te są odpowiednie również dla poważniejszych stanów, gdzie wyższy poziom stymulacji mógłby być być zbyt obciążający.
Są również odpowiednie dla starszych pacjentów oraz pacjentów z zaburzeniami rytmu, którzy czują się lepiej w podgórskim leśnym klimacie niż w wysokogórskim. Ta lokalizacja jest również odpowiednia dla kombinacji leczonych wskazań z chorobami reumatycznymi, przy czym bardzo korzystny klimat jest dla rekonwalescencji po ciężkich stanach i rozległych operacjach. Pieniny są wyjątkowe, ponieważ w tak niewielkiej odległości poziomej znajdują się wszystkie typy klimatu górskiego, a także środowiska jaskiniowego.